Az 1.3-as verzió forradalmian sok változást fog tartalmaz eme népszerű játékhoz.
A legdrámaibb változás talán az lesz hogy fogják az egyjátékos módot és kivágják a kukába, helyette pedig rákoncentrálnak a többjátékos részre. Ez két jelentős előnnyel is járni fog. Az egyik hogy nem kell két helyen javítani a hibát az egyjátékos és többjátékos módban külön-külön, a másik pedig szükség lesz az úgynevezett modding api-ra ami azt hivatott elérni hogy minden egyes Minecraft frissítés után ne keljen a modokat is frissíteni.
A változások közé tartozik még a smaragd érc, amit valutaként lehet használni a falvakban árú eladására és vételére. Képesek leszünk könyvet írni, drótcsapdát létrehozni, új lépcsők, új fél-táblák, kakaó növény, levelek, üstök, fékkarok, kavics, nyomólemezek, sütik, hajók, vödrök, jég, kemencék. Plusz kapsz mágikus gömböket a bányászatból és kohászatból.
Puszta tényként még közölték hogy az "Advanture mod"-ot amit ígértek az 1.4-es verzióban kapjuk meg.
Az 1.3-as verzióban azért lesz tömérdek mennyiségű változás hogy a monitor elég szögezze a Minecraft rajongókat, amíg valamikor a jövőben meg nem jelenik az 1.4-es verzió.